Les Gypaètes vivent généralement en couple dans un territoire fixe au-dessus de la limite supérieure de la forêt. Ce territoire est défendu avec détermination contre toute intrusion d'un congénère. Mais face à d'autres espèces telles que l'aigle, ils se comportent toutefois de manière assez pacifique. Les couples de Gypaètes créent généralement plusieurs aires sur leur territoire, situées dans des niches de falaises inaccessibles et protégées contre les intempéries. En automne, on peut observer les oiseaux en train de construire ou d'aménager leurs nids. Ceux-ci se composent de branches, d'herbes, de laine de mouton et de poils d'origine animale.